广西大学附属中学始建于1934年，1972年起开始面向社会招生，招收适龄儿童入学。1998年原广西大学附属中学和原广西农业大学附属中学合并组建新的广西大学附属中学，并于当年经自治区教育厅批准按照国有民办模式运作。2003年学校先后贷款四千多万元在现在的校址兴建了新校区。2009年，广西大学附属中学经自治区教育厅批准规范为民办学校。