中国医学科学院北京协和医学院药物研究所（以下简称药物所）成立于1958年，学科齐全、设备先进、科研和教学力量雄厚,是在国内具有显著地位、在国际药学界具有影响力的国家级重点药物研究机构。药物所主要研究方向包括抗肿瘤药物、防治心脑血管疾病药物、治疗神经精神类疾病药物、抗代谢紊乱药物、抗感染药物、抗炎免疫类药物、治疗老年退行性疾病药物等。建所60年来已研制上市新药百余种，获得新药证书132项，其中原创新药22项，以药物所作为第一完成单位共获得科技成果奖励200余项，其中国际及国家级奖项31项（国家科技进步奖一等奖3项）。药物所下设合成药物化学、天然药物化学、药理学、药物分析、生物合成、药物筛选、药物晶型、药物制剂、药物代谢、新药开发、安全评价等研究科室，拥有7个省部级重点实验室，5个院校级重点实验室/中心，同时拥有6家所属企业，构建了完整的产学研用生态循环体系。药物所是我国高级药学人才的培养基地。2022年药学再次入选第二轮“双一流”建设学科名单。